单位漏缴社保滞纳金问题，需关注以下法律风险：1、诉讼时效风险：劳动者主张权利时效为一年。例如，某员工三年前社保被漏缴，如今才投诉或起诉，可能因超过一年时效，无法通过法律途径要求单位补缴社保和承担滞纳金，自身权益受损。2、证据链风险：缺乏工资条或社保缴纳记录，可能无法证明单位过错。比如，劳动者仅口头称单位漏缴社保，却无工资条证明劳动关系与工资发放情况，也无社保记录证明漏缴事实，维权时难以获支持，单位无需承担滞纳金等责任。
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单位漏缴社保滞纳金，一般由用人单位负责。若用人单位未按时足额为员工缴纳社保，根据相关法律规定，滞纳金应由用人单位承担。因为用人单位是社保缴纳的法定义务主体，未履行义务产生的滞纳金，理应由其承担。
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单位漏缴社保滞纳金的处理，可能受以下特殊情况影响：1、劳动者自愿放弃社保，可能需承担部分责任。此时，用人单位虽有缴纳社保的法定义务，但劳动者自愿放弃的行为可能被用人单位用作抗辩理由，影响滞纳金的承担比例或处理方式，社保部门处理时也会综合考虑这一因素。2、企业因计算错误少量漏交，及时补缴可减轻处罚。若企业因计算错误少量漏缴社保，且发现后及时主动向社保部门补缴，社保部门可能根据实际情况，对企业从轻或减轻征收滞纳金，与故意长期大量漏缴的处理结果不同。3、政策调整影响补交金额及滞纳金计算。不同地区社保政策可能调整，若单位漏缴期间当地社保政策变化（如缴费基数、滞纳金计算比例等），会直接影响社保补交金额及滞纳金具体数额，进而影响整个漏缴问题的处理。

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